NVIDIA ドライバをセットアップしたとき、以下のファイルがインストールされました。

このうち、libGL.so.1, libglx.so はそれぞれ ports のlibGL, xorg-server がインストールしたものを置き換えてしまいます。従って元の環境を復元するためにはセットアップ前にバックアップをとっておく必要があります。また逆に、libGL, xorg-server をアップデートすると NVIDIA ドライバがセットアップしたファイルを上書きしてしまいますのでご注意ください。

/boot/modules/nvidia.ko
/boot/modules/linker.hints
/usr/local/lib/libGL.so
/usr/local/lib/libGL.so.1
/usr/local/lib/libnvidia-cfg.so.1
/usr/local/lib/libnvidia-cfg.so
/usr/local/lib/libnvidia-tls.so
/usr/local/lib/libnvidia-tls.so.1
/usr/local/lib/libGLcore.so
/usr/local/lib/libGLcore.so.1
/usr/local/lib/libXvMCNVIDIA.a
/usr/local/lib/libXvMCNVIDIA.so
/usr/local/lib/libXvMCNVIDIA.so.1
/usr/local/lib/libvdpau_trace.so
/usr/local/lib/libvdpau_nvidia.so
/usr/local/lib/libvdpau.so
/usr/local/lib/libvdpau.so.1
/usr/local/lib/vdpau/libvdpau_nvidia.so.1
/usr/local/lib/vdpau/libvdpau_trace.so.1
/usr/local/lib/xorg/modules/extensions/libglx.so
/usr/local/lib/xorg/modules/extensions/libglx.so.1
/usr/local/lib/xorg/modules/drivers/nvidia_drv.so
/usr/local/bin/nvidia-bug-report.sh
/usr/local/bin/nvidia-xconfig
/usr/local/bin/nvidia-settings
/usr/local/man/man1/nvidia-xconfig.1
/usr/local/man/man1/nvidia-settings.1